Lễ bốc thăm vòng bảng Cúp C1 Đông Nam Á 2025/2026 diễn ra vào ngày 4/7 trong bối cảnh giải chỉ còn 12 đội tham dự thay vì 14 như kế hoạch ban đầu. Hai CLB của Indonesia rút lui khiến thể thức giải đấu có nguy cơ thay đổi.
Đến ngày 13/7, Liên đoàn Bóng đá Đông Nam Á (AFF) ra thông báo chính thức. Theo quyết định mới từ AFF, vòng tứ kết bị loại bỏ. Thay vào đó, hai đội dẫn đầu mỗi bảng giành vé trực tiếp vào bán kết. Thể thức này tương tự mùa giải trước, giúp lịch thi đấu được rút gọn trong bối cảnh giải có ít đội hơn dự kiến.

Việc cắt giảm số vòng đấu khiến hành trình vượt qua vòng bảng của các đội càng trở nên khắc nghiệt, đặc biệt với hai đại diện Việt Nam là CLB CAHN và Nam Định. Để đi tiếp, mỗi đội phải kết thúc vòng bảng với vị trí nhất hoặc nhì trong số 6 đối thủ.
CLB CAHN rơi vào bảng A cùng Buriram United, BG Pathum United (Thái Lan), Selangor (Malaysia), Tampines Rovers (Singapore) và đội thắng trong cặp Kasuka (Brunei) hoặc Cebu (Philippines).

Nam Định nằm ở bảng B, nơi có sự góp mặt của Bangkok United (Thái Lan), Johor Darul Ta'zim (Malaysia), Lion City Sailors (Singapore), Svay Rieng (Campuchia) và đội thắng trong cặp Ezra (Lào) hoặc Shan United (Myanmar).
Với việc đối đầu loạt đội bóng hàng đầu khu vực, thử thách dành cho Nam Định và CAHN là không nhỏ trong hành trình tìm vé vào bán kết.